Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
STRCP1A6NGW2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
STRCP1A6NGW2 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms