Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM247A6NEH6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms