Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
E2F8A0AVK6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms