Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PHF8Q9UPP1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PHF8Q9UPP1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms