Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EDARQ9UNE0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms