Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MED23Q9ULK4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms