Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD3Q9UJU5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms