Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms