Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
COPS7AQ9UBW8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPS7AQ9UBW8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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