Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF7Q9UBF6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF7Q9UBF6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF7Q9UBF6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RNF7Q9UBF6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF7Q9UBF6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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