Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLAIN2Q9P270 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLAIN2Q9P270 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLAIN2Q9P270 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLAIN2Q9P270 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLAIN2Q9P270 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLAIN2Q9P270 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms