Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MBD5Q9P267 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MBD5Q9P267 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms