Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC88CQ9P219 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms