Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TDP1Q9NUW8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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