Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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TMEM27Q9HBJ8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM27Q9HBJ8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TMEM27Q9HBJ8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TMEM27Q9HBJ8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TMEM27Q9HBJ8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TMEM27Q9HBJ8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TMEM27Q9HBJ8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TMEM27Q9HBJ8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TMEM27Q9HBJ8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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TMEM27Q9HBJ8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM27Q9HBJ8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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