Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SEBOXQ9HB31 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms