Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NRDE2Q9H7Z3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms