Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LRRN3Q9H3W5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LRRN3Q9H3W5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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