Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BCL11BQ9C0K0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms