Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BHLHE41Q9C0J9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms