Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CEP44Q9C0F1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CEP44Q9C0F1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms