Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIFKQ9BYG3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms