Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC4A5Q9BY07 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms