Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCP2Q9BX26 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYCP2Q9BX26 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms