Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFT27Q9BW83 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFT27Q9BW83 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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