Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MESP1Q9BRJ9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms