Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms