Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PKP4Q99569 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PKP4Q99569 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PKP4Q99569 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PKP4Q99569 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PKP4Q99569 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PKP4Q99569 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PKP4Q99569 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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