Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUP88Q99567 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NUP88Q99567 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms