Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCT8L2Q96SF2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms