Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
JSRP1Q96MG2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
JSRP1Q96MG2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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