Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC41A2Q96JW4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms