Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COG3Q96JB2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms