Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC1Q96C34 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms