Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RNF34Q969K3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNF34Q969K3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms