Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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USP9XQ93008 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP9XQ93008 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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