Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC4Q8WW27 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms