Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
FAT3Q8TDW7 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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