Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL22A1Q8NFW1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL22A1Q8NFW1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms