Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A3Q8NEV1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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