Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTC21AQ8NDW8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TTC21AQ8NDW8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms