Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AMER3Q8N944 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms