Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SKAP1Q86WV1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms