Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF554Q86TJ5 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZNF554Q86TJ5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms