Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC29A4Q7RTT9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC29A4Q7RTT9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms