Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC80Q76M96 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms