Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCD1Q6ZMY3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms