Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LMBR1LQ6UX01 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LMBR1LQ6UX01 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms