Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSSK4Q6SA08 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms