Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EDC4Q6P2E9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDC4Q6P2E9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms